期刊简介
《中国组织工程研究与临床康复》（原《中国临床康复》）杂志系卫生部主管，中国康复医学会、《中国组织工程研究与临床康复》杂志社主办的国家级学术期刊。经新出报刊[2006]288号批准，《中国临床康复》更名为《中国组织工程研究与临床康复》，变更后国内统一连续出版物号为CN 21-1539/R，ISSN 1673-8225，国内外公开发行，发行代号8-584，周刊，200页/期，A4开本。 更名后的《中国组织工程研究与临床康复》推出2009年的全新策划,年出版53期,各周刊征稿重点邀您参与,请您评估。网址：www.crter.org
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首页>中国组织工程研究杂志
- 杂志名称：中国组织工程研究杂志
- 主管单位：中华人民共和国卫生部
- 主办单位：中国康复医学会,《中国组织工程研究与临床康复》杂志社
- 国际刊号：2095-4344
- 国内刊号：21-1581/R
- 出版周期：周刊
期刊荣誉：百种中国杰出学术期刊期刊收录：维普收录(中), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 知网收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 剑桥科学文摘, 万方收录(中)
生物信息学分析肝癌干细胞中致瘤基因表达的差异
李淑娜；宋娜娜
关键词：干细胞, 肿瘤干细胞, 肝癌, 致瘤基因, 生物信息学, 信号通路, 生物功能, 细胞培养, 差异基因, 基因芯片, 组织工程
摘要：背景：研究认为，肝癌干细胞中致瘤基因表达与肝癌的发生、发展具有一定的关系，但目前尚缺乏对生物信息学和机制的研究。目的：对于肝癌干细胞相关的致瘤性差异基因进行筛选，并对其进行生物信息学分析。方法：将人肝癌细胞株HepG2作为肝癌干细胞的细胞工具制备总RNA并进行荧光标记，使用基因芯片进行杂交试验，将获得的 mRNA 表达谱进行筛选后获得差异性 mRNAs，利用生物信息学进行 GO注释和Pathway注释分析。结果与结论：芯片杂交实验的检出率为73.21%，说明杂交试验是成功的；实验共有38342个mRNA被发现，进一步分析后，筛选差异性表达基因1236个(P<0.05，fold change≥2)，其中上调和下调表达基因的数量分别为599和637个(P <0.05)；表达差异基因的生物学功能主要涉及到了组蛋白的H4乙酰化，细胞的有丝分裂以及增殖、细胞相关蛋白质的合成以及分解、染色体的分离、细胞的分化以及凋亡、信号的转导、营养物质的运输、转录；Pathway 注释主要涉及细胞因子介导的炎症信号通路、Wnt信号通路、Hedgehog通路以及Notch通路、TGF-Beta和Jak-STAT等。结果证实，肝癌干细胞中的差异表达基因与肝癌的发生有关，也可能参与信号通路的调控，这可为肝癌的治疗提供一种新靶点。
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